Большая часть территории Литвы была освобождена Красной Армией в 1944 г. последовательно в ходе Белорусской и Прибалтийской стратегических наступательных операций. 13 июля 1944 г. был освобожден Вильнюс, а 1 августа – Каунас. В январе 1945 г. от немецко-фашистских войск был очищен Клайпедский (Мемельский) край, аннексированный гитлеровской Германией в марте 1939 года.
В ходе боевых действий советские войска взяли в плен 43 966 немецких солдат и офицеров, захватили 912 орудий, 67 танков и штурмовых орудий, 3884 автомашины и тягача, другие трофеи. 80 600 бойцов и командиров Красной армии погибли, освобождая территорию Литвы от немецко-фашистских захватчиков.
14 сентября – 24 ноября 1944 г. с целью завершения освобождения Прибалтики войсками Ленинградского 3-го, 2-го и 1-го Прибалтийских, 3-го Белорусских фронтов и частью сил Балтийского флота была проведена Прибалтийская операция.
Летом 1944 года советские войска в ходе успешного наступления освободили почти всю Литву, значительную часть Латвии и юго-восток Эстонии. Части 1-го Прибалтийского фронта (генерала армии И.Х. Баграмяна) в июле вышли к берегу Рижского залива западнее Риги, отрезав, таким образом, значительную часть группы армий «Север» от Германии. Однако в августе противник, собрав значительные силы, перешёл в контрнаступление. Хотя советским войскам удалось отразить удары гитлеровцев почти на всех направлениях, немцы всё же смогли оттеснить части 1-ого Прибалтийского фронта от Рижского залива, восстановив сухопутную связь со своими отрезанными дивизиями.
Успехи советских войск в летнем наступлении 1944 г. создали хорошие предпосылки для последующего полного разгрома группы армий «Север». В этой связи Ставкой ВГК был разработан план Прибалтийской стратегической наступательной операции. Численность группировки советских войск составляла 1 546 400 человек, которую поддерживали свыше 3080 танков и самоходных орудий, 17 480 орудий и миномётов и 2640 боевых самолётов.
Осознавая стратегическую важность Прибалтики, противник собирался упорно оборонять ее территорию.
Наступление советских войск началось 14 сентября. Все три Прибалтийских фронта наносили удар на Ригу с северо-востока, востока и юга. В первый же день 43-я армия (генерала-лейтенанта А.П. Белобородова) 1-го Прибалтийского фронта прорвала оборону противника и уже 16 сентября вышла к р. Даугаве в 20 км от Риги. Однако здесь противник собрал значительные силы, в том числе большую часть танков, что позволило немцам нанести по частям 43-й армии сильный контрудар. Ожесточенные бои длились с 16 по 22 сентября, но бойцы Белобородова смогли удержаться на достигнутых рубежах.
Бои на рижском направлении приняли затяжной характер, и 24 сентября Ставка ВГК решила перенести направление главного удара с Риги на Мемель (ныне г. Клайпеда). 17 сентября в наступление перешли войска Ленинградского фронта. Маршалу Говорову удалось скрытно и в кратчайшие сроки перебросить в район Тарту 2-ю ударную армию (генерала-полковника И.И. Федюнинского), поэтому появление здесь крупных сил Красной армии стало полной неожиданностью для гитлеровского командования. Дивизии 2-й уд. армии успешно преодолели оборону противника и с боями устремились к Финскому заливу, выходя в тыл основным силам группы «Нарва», оборонявшимся на перешейке между Чудским озером и Финским заливом. Опасаясь окружения этой группы, Шёрнер приказал ей отходить. Преследуя отступающего противника, 22 сентября части 8-й армии освободили Таллин, а 2 уд. А продолжала успешно наступать на Пярну. К 27 сентября вся материковая часть Эстонии была освобождена.
26 сентября 8-я А (генерала-лейтенанта Ф.Н. Старикова) начала операцию по освобождению островов Моонзундского архипелага. Наиболее сильно был укреплён остров Сааремаа. 27 сентября – 2 октября части 8-й армии при поддержке кораблей и авиации Балтийского флота освободили острова Вормси, Муху и Хийумаа, а 5 октября началась высадка на Сааремаа. Враг оборонялся с упорством обречённых. Лишь 7 октября удалось освободить большую часть острова. Остатки гарнизона отошли на укреплённый полуостров Сырве в юго-западной части острова и оборонялись там до 24 ноября. Таким образом, Эстония была полностью освобождена. Безвозвратные потери Ленинградского фронта составили 6 219 человек, тогда как только в сентябре войска фронта пленными взяли 16 тыс. солдат и офицеров противника.
Пока шли бои за острова, советское командование воспользовавшись тем, что основные силы немцев стянуты под Ригу, нанесло силами 1-го Прибалтийского фронта мощный удар в направлении Мемеля. Наступление началось 5 октября из района города Шауляй. Переброшенная сюда 43-я армия вновь быстро прорвала оборонительный рубеж гитлеровцев, что позволило Баграмяну ввести в прорыв 5-ю гвардейскую танковую армию (генерал-полковника В.Т. Вольского). Сметая на своем пути очаги сопротивления противника, советские танкисты 11 октября вышли на побережье Балтийского моря в районе Паланги, вновь перерезав сухопутные коммуникации группы армий «Север». Продолжая наступление войска фронта совместно с 39-й армией (генерал-полковника И.И. Людникова) 3-го Белорусского фронта к 20 октября освободили всю Литву. Лишь в районе Мемеля немцы, опираясь на мощные укрепления, смогли удержаться на своих позициях.
Тем временем, преодолевая ожесточенное сопротивление противника, войска 2-го и 3-го Прибалтийских фронтов 12 октября ворвались на окраины Риги. После трёхдневного ожесточенного сражения столица Латвии была освобождена.
В ходе Прибалтийской стратегической наступательной операции советские войска освободили территорию почти всей Прибалтики.
В ходе боёв в Прибалтике советские войны проявили образцы мужества и героизма. Только за сентябрьские бои 112 солдат и офицеров были удостоены звания Герой Советского Союза, свыше 300 тыс. человек были награждены орденами и медалями, 131 воинская часть получила почётные наименования.